肛瘘是肛肠疾病中比较严重的一种，作为一种高发性肛门疾病，肛瘘的发病率仅次于痔疮。其危害也比其他肛肠疾病要大的多，患者应当及时地接受治疗，肛瘘的危害性和痛苦程度也只有得过肛瘘的患者们才有切身的体会。

感染流脓

肛瘘一旦形成，自愈的机会极少，并带来一系列的危害。首先肛瘘感染发炎后，肛门疼痛剧烈，溃破后脓水污染内裤，脓汁刺激局部皮肤，肛门瘙痒剧烈。久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，发作亦越频繁，形成互为因果。

肛门失禁

任由肛瘘发展，可对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。

瘘口、瘘管增加

肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。

危及临近器官及癌危险

肛瘘是一种多发性疾病，长期拖延可形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，如此，危及周围脏器也就势在必然。另外，如果是多年未愈，发生癌变的可能性就会水涨船高。

影响肛门的正常功能

肛瘘和肠炎一样，不是一朝一夕就能治好的，即便是治疗好了，护理不当也会造成复发，只要是反复发作，脓液就可穿破瘘管壁顺括约肌间隙蔓延，进而形成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，还严重地影响了肛门的正常生理功能。