包茎的危害远大于包皮过长，会对患者及其妻子的健康产生一定的影响，因此必须引起重视。

阻碍发育：包茎、阴茎和龟头的发育往往受到限制，由于发育受到限制，从外观上看似小阴茎。

感染：尿液中的沉积物和尿垢积聚在包皮中，成为细菌培养剂，或因刺激而引起炎症、并导致包皮粘连，严重时还会导致不孕。

堵塞：因为包皮口太小，先在包皮腔膨胀再排空。排尿困难时，会出现压力回流现象。膀胱壁较弱，由于压力高，形成膀胱憩室;这种憩室，壁很薄，容易受伤和破裂，病情严重，患者时间长，会导致输尿管扩张和肾盂积水。由于排尿困难，腹部压力增加，可能有肛门脱离或疝气，有时有“睡室双排尿”。

结石：粘膜上皮细胞发炎后脱落，作为核心，外围因垢形成包皮结石。父母发现孩子的包皮腔里有小硬块，大部分都很焦虑。事实上，只要包茎环稍微扩大，就可以取出结石。

性病：包皮过长或包茎容易患炎症感染，因为内板和龟头经常处于潮湿的环境中、炎症感染等性病，由于局部无法清洗，也容易使妻子患上与患者相同的性病。

此外，包茎引起的阴茎头慢性炎症往往是阴茎癌的重要病因，因此，除儿童生理性包茎外，病理性包茎应积极手术治疗。