习惯性流产可能存在男性的因素，因为男性配子基因内容占胚胎的一半。精子染色体核型异常，是导致其妻子先后流产的根源。“流产男人”的精子染色体畸变，如数量异常或结构异常，或基因突变，或精液质量降低均可导致胚胎发育异常而引起妻子流产。

国外有学者调查了详细的精子质量，发现弱精子质量和习惯性早期流产相关。有报道称少精症和多精症反复流产的发病率分别为37.6%和20.0%。畸形精子增加也可以引起反复流产。精子为胚胎提供了50%的基因，除了受孕功能，精子的基因所起的作用贯穿胚胎发育的整个过程。受孕功能属于精子的早期效应，而在胚胎发育也就是女性怀孕过程中所起的作用，属于精子的晚期效应。如果精子的遗传物质DNA发生损伤，可以不影响精子受孕功能，精子可以与卵子相遇并结合，女人同样会正常怀孕，但到了怀孕的中晚期，精子DNA晚期效应不正常，会导致胚胎发育停滞，而出现流产现象。

判断精子的DNA损伤的指标常用的为DNA片段化指数，优良的精子DFI应该在15%以下，15%-25%代表精子尚好，大于30%为精子DNA严重损伤。“流产男人”的精子DFI往往在25%以上。一般的男方精液常规、精子形态以及精子染色体很难发现异常，因此很容易被人遗漏和忽视。

胎儿基因来自父母双方各一半，来自父亲的那一半对于母亲的身体而言是一种“异物”，而人体的免疫系统具有自我保护的功能，面对体内出现的“异物”，人体的免疫系统很容易就对其进行排斥甚至扼杀，终自然流产。所以临床对习惯性流产夫妇应系统检查。

“流产男人”另一因素，那就是男方的年龄。成年男性随着年龄的增加，生育能力也逐步下降。老龄男性中可出现睾丸组织渐萎缩、精子日生成量减少、睾丸生殖组织形态学的改变及细胞突变或异倍体增加，以致精子质量降低、受孕率降低、流产率增加、子代常染色体区域显性遗传疾病增加及胎儿死亡率增加。年龄造成流产这与精子质量特别是精子活力下降及畸形率有关。