肛门病毒疣在治疗后确实存在复发的可能性。复发的原因可能涉及多个方面，包括免疫力低下、治疗不完全、存在交叉感染以及生活习惯等。

首先，免疫力低下是导致肛门病毒疣复发的主要因素之一。如果患者本身免疫力低下，如存在糖尿病、肝硬化等疾病，或长期服用免疫抑制剂、糖皮质激素等导致免疫力下降，此时机体容易受到病毒感染，就可能会导致肛门病毒疣复发。因此，患者在治疗过程中和治疗结束后，都应注重增强免疫力，如通过合理饮食、适量运动等方式来提高身体素质。

其次，治疗不干净也是导致复发的重要原因。如果在治疗期间没有完全清除体内的病毒，或者只是表面症状好转而未能治根，那么病毒可能会在停药后再次复发。因此，患者在治疗过程中应积极配合医生的治疗方案，确保治疗疗效。

此外，交叉感染也是导致复发的不可忽视的因素。如果患者在治好后与他人密切接触，导致再次感染人乳头瘤病毒，那么肛门病毒疣就会复发。因此，患者在日常生活中应注意个人卫生，避免与他人共用毛巾等物品，以减少交叉感染的风险。

再者，生活习惯也对肛门病毒疣的复发有一定影响。长期久坐、饮食辛辣刺激等不良生活习惯可能会增加复发的风险。因此，患者在治好后应保持良好的生活习惯，如适量运动、清淡饮食等，以减少复发的可能性。

总之，肛门病毒疣在治疗后存在复发的风险，但患者可以通过增强免疫力、有效治疗、避免交叉感染以及保持良好的生活习惯等方式来降低复发的可能性。同时，患者也应定期进行体检和复查，以便及时发现并处理可能存在的问题。如果出现复发情况，应及时就医并遵循医生的治疗建议。