肛门内有疣是否会引发疼痛是一个相对复杂的问题，因为它取决于多种因素。一般来说，肛门内的疣体可能会导致一些不适症状，其中包括疼痛，但并非所有情况下都会引发剧烈疼痛。

肛门疣主要是由人乳头瘤病毒感染引起，这种疣体生长缓慢且多为单发。在大多数情况下，肛门疣不会对周围组织造成明显的压迫或刺激，因此不会引发剧烈的疼痛。然而，在某些特定情况下，如疣体较大、受到摩擦或发生感染时，可能会导致局部出现轻微的不适感或疼痛。

除了疼痛，肛门疣还可能导致其他不适症状，如异物感、瘙痒和潮湿等。由于疣体的存在，肛门部位可能会出现凹凸不平的症状，从而刺激局部组织产生异物感。同时，疣体生长也可能导致局部脓性分泌物增多，引起周围组织瘙痒。如果疣体破溃出血，还可能引发感染，导致糜烂和恶臭等症状的出现。

对于肛门内有疣的患者来说，如果疼痛或其他不适症状加剧或持续存在，应及时就医以排除其他潜在病因。医生可能会进行全面的身体检查以及必要的实验室检测，以确诊是否为肛门疣，并排除其他可能的疾病。

在治疗方面，肛门疣的治疗方法包括药物治疗、物理治疗以及手术治疗等。药物治疗主要使用抗病毒药物、免疫调节剂等，以控制病毒的复制和增强机体免疫力。物理治疗如激光、冷冻、电灼等，可以去除疣体并减轻症状。对于较大的疣体或病情较重的患者，可能需要考虑手术治疗。

总的来说，肛门内有疣可能会引发疼痛，但并非所有情况下都会如此。患者应根据自身症状及时就医，并在医生的指导下进行诊断和治疗。同时，保持良好的生活习惯和避免不洁性生活也是预防肛门疣的重要措施。

请注意，以上内容仅供参考，不能作为医学诊断、治疗依据或指导建议。请您随时关注身体状况，切勿盲目用药或治疗，如遇病情变化或感觉任何不适，建议您及时向专业人士求助，可线上咨询医生，或者去线下医疗机构就诊。