甲鱼肉烧不烂可能与肉质特性、烹饪方法不当有关。甲鱼肌肉纤维紧密且胶原蛋白含量高，需长时间炖煮才能软化。
甲鱼肉质地坚韧主要因其肌肉结构特殊。甲鱼活动时需支撑厚重甲壳，肌肉纤维排列紧密且富含结缔组织。这类组织中的胶原蛋白在60℃以下难以分解，普通快炒或短时间蒸煮无法破坏其结构。传统做法通常采用砂锅小火慢炖数小时，利用持续热力使胶原蛋白转化为明胶，肉质才会变得酥烂。若使用高压锅可缩短时间，但需控制压力避免过度沸腾导致肉质紧缩。
部分情况下甲鱼品种差异也会影响烹饪效果。野生甲鱼因长期活动肉质更紧实，养殖甲鱼运动量少相对容易炖烂。老甲鱼比幼年甲鱼胶原蛋白交联程度高，需要更长时间处理。此外甲鱼宰杀后未充分排酸或冷冻保存过久，肌肉细胞脱水也会增加炖煮难度。处理时建议先焯水去除表面黏液，加入山楂或醋等酸性物质能帮助软化纤维。
烹饪甲鱼建议选择重量适中的养殖个体，宰杀后尽快处理。搭配富含脂肪的食材如五花肉共同炖煮，利用油脂促进脂溶性风味物质释放。使用砂锅或铸铁锅保持恒温，避免频繁揭盖导致温度波动。可加入黄酒、姜片去腥，最后半小时放入山药、枸杞等配料防止过度软烂。若追求更佳口感，可提前用蛋白酶腌制或采用低温慢煮工艺。
