水果保存的关键在于控制湿度、温度和通风条件，主要有冷藏保存、常温避光、分类存放、预处理保鲜、密封隔离等方法。
部分水果如草莓、葡萄适合冷藏保存。低温能延缓微生物繁殖速度，但热带水果如香蕉、芒果冷藏会导致冻伤变黑。冷藏前无须清洗，用厨房纸包裹吸收表面水分，放入保鲜盒留出透气孔，温度设定在4-8摄氏度较为适宜。
苹果、梨等温带水果适合阴凉通风处存放。阳光直射会加速水分蒸发和氧化，建议用透气的竹篮或纸袋盛装，避免使用塑料袋密封。这类水果会释放乙烯气体，需与其他易感水果分开存放，防止催熟腐败。
乙烯敏感型水果如猕猴桃、西瓜应与高乙烯释放型水果分开放置。可将苹果、香蕉等单独存放，或用保鲜膜包裹茎部减少乙烯释放。根茎类水果如菠萝可倒置存放，减缓糖分向顶部集中导致的局部腐烂。
柑橘类水果可用蜡纸逐个包裹阻隔空气，浆果类可薄铺于托盘冷冻后装袋。切开的水果需去除果核果蒂，表面滴柠檬汁抗氧化，用保鲜膜紧密贴合并尽快食用。芒果等可裹面粉吸收表面水分延长保存期。
真空密封适合水分含量低的水果干，新鲜水果可用带透气孔的保鲜盒。在容器内垫入吸水材料如木炭或硅胶干燥剂，定期更换保持干燥。霉变水果需立即隔离处理，避免孢子污染其他果实。
不同水果的呼吸强度和乙烯敏感性差异较大，建议根据种类特性选择保存方式。未成熟水果可常温催熟后冷藏，已成熟的要尽快食用。定期检查存放情况，及时去除变质果实。清洗水果建议在食用前进行，避免储存期间水分残留加速腐败。对于易腐水果，可加工成果酱或冷冻保存延长食用期限。
