判断柠檬是否变质可通过观察外观、气味、触感和切面状态综合评估。新鲜柠檬表皮鲜亮紧实，变质后可能出现霉斑、软烂或干瘪，伴有酸腐异味。
新鲜柠檬表皮呈均匀亮黄色或青黄色，表面光滑无斑点。变质时可能出现绿色或黑色霉斑，表皮皱缩失去光泽。若发现局部发黑或大面积变色，通常已不适合食用。部分长期存放的柠檬可能出现白色粉状物质，属于霉菌滋生迹象。
正常柠檬散发清新柑橘香气，切开后酸味纯净无杂味。变质后会产生明显发酵酸臭或霉味，即使未切开也能闻到异味。若表皮有伤口且散发酒味，说明内部已开始腐败发酵。
新鲜柠檬质地坚硬，按压时有弹性且回弹快。变质后果皮变软，按压后出现凹陷且难以恢复，严重时内部组织液化，摇晃可感觉汁液晃动。干燥储存过久的柠檬会整体发硬，但切开后果肉仍应保持多汁状态。
切开后新鲜柠檬果肉饱满多汁，囊瓣分明呈半透明状。变质后果肉发黄发褐，囊瓣干瘪分离，可能出现絮状菌丝或黏液。若中心柱部位出现褐色纤维化，说明新鲜度严重下降。
常温保存的柠檬保质期约1-2周，冷藏可延长至1个月。超过此期限即使外观完好也应谨慎食用。已切开的柠檬需用保鲜膜包裹冷藏，最好在2-3天内用完，切口变干或发红即提示变质。
日常储存柠檬建议用透气网袋装好置于阴凉处，避免潮湿环境加速霉变。购买时选择表皮无损伤、重量沉甸的果实。若发现柠檬变质，整颗丢弃勿尝试切除腐败部分食用，霉菌产生的毒素可能已扩散至整个果实。适量购买及时食用，可搭配蜂蜜或冰糖制作柠檬水提升保存性。
