半个菠萝蜜可以冷藏或冷冻保存，具体方法取决于食用计划。未食用完的菠萝蜜需去除果核并用保鲜膜密封，冷藏可保存2-3天，冷冻可延长至1个月。菠萝蜜含糖量高，保存不当易滋生细菌或氧化变质。
冷藏保存适合短期内食用的情况。将果肉从果核上剥离后装入密封盒或用保鲜膜包裹两层，减少与空气接触。冷藏温度需控制在4℃以下，存放时避免与其他气味强烈的食物接触。冷藏后的菠萝蜜口感会略微变软，但甜度和风味基本保留，适合直接食用或制作甜品。
冷冻保存能更长时间维持品质。将果肉分装进食品级密封袋，排出空气后平铺冷冻。冷冻会使果肉细胞结构变化，解冻后更适合用于烹饪或搅拌成冰沙。解冻时建议移至冷藏室缓慢回温，避免高温水解导致口感变差。冷冻保存的菠萝蜜营养成分流失较少，维生素C和钾元素保留率较高。
无论采用哪种保存方式，切开的菠萝蜜需在2小时内处理完毕。果核周围的白色絮状物含有天然防腐成分，可保留部分与果肉一起存放。若发现果肉发黏、出水或产生酸味应立即丢弃。日常食用建议根据家庭成员数量购买合适大小的菠萝蜜，完整未切的菠萝蜜在阴凉通风处可存放3-5天。
