杨梅可用淡盐水浸泡、流水冲洗、小苏打清洗、面粉吸附、果蔬清洁剂处理等方式清洗。
将杨梅放入浓度为3%的淡盐水中浸泡10分钟，盐分能帮助溶解表面农药残留并驱离果蝇幼虫。浸泡时轻轻搅动使杂质脱落，之后用凉开水冲洗两遍。此方法适合表皮娇嫩的杨梅，但浸泡时间过长可能导致果肉渗入咸味。
用流动的清水持续冲洗杨梅表面30秒以上，水流压力有助于冲走附着在果蒂凹陷处的灰尘。冲洗时用手指轻搓果皮，重点清洁果蒂与果实连接处。该方法对杨梅组织损伤最小，但无法完全去除脂溶性农药。
每升清水加入5克食用小苏打，将杨梅浸泡5分钟后搓洗。小苏打的弱碱性可分解部分有机磷农药，同时中和果实表面酸性污渍。需注意小苏打溶液浓度过高可能破坏杨梅表皮的天然果粉。
干燥杨梅表面水分后撒少量面粉，轻轻揉搓使面粉包裹果实。面粉颗粒能吸附沟壑中的灰尘和虫卵，静置3分钟后用冷水冲净。该方法对保留杨梅完整形态最有利，但需确保面粉无添加剂。
选用标明可食用作物的专用清洁剂，按说明书比例稀释后浸泡杨梅2分钟。清洁剂中的表面活性剂可去除蜡质层下的污染物，使用后需用大量清水漂洗避免化学残留。该方法清洁效果最彻底，但敏感体质者慎用。
清洗后的杨梅建议用厨房纸吸干水分，立即食用或冷藏保存。避免使用钢丝球等硬物刮擦，挑选时选择果蒂鲜绿、无渗液的果实。杨梅季可一次性清洗后分装冷冻，制作甜品时直接取用能保持更好风味。日常食用每日不超过15颗为宜，胃酸过多者应减少空腹食用。
