防止土豆发芽的方法主要有低温储存、避光保存、控制湿度、隔绝空气、搭配存放。
将土豆置于4-8℃的阴凉环境中可显著抑制发芽。冰箱冷藏室下层或未供暖的阳台是理想选择，但需注意避免温度低于0℃导致冻伤。研究表明，10℃以上环境会激活土豆休眠芽的生长机制，而低温能延缓这一过程约3-6个月。
光照会促使土豆表皮产生龙葵碱毒素并发绿。建议使用不透光的陶罐、黑色塑料袋或加盖纸箱存放，确保完全隔绝自然光和人工光源。实验数据显示，避光保存的土豆发芽时间比暴露在光照下的延迟2倍以上。
保持65%-75%的相对湿度最为适宜。过于干燥会导致土豆失水皱缩，湿度过高则易霉变。可在储存容器内放置干燥的锯末或报纸吸潮，定期更换。监测发现，湿度控制在70%左右时，土豆保鲜期可延长至5个月。
采用真空密封袋抽除空气，或使用保鲜膜紧密包裹，能有效阻断氧气接触。氧气浓度低于5%时，土豆呼吸作用减弱，发芽相关酶活性降低。家庭可用水浸法短期保存：将完整无伤的土豆完全浸没在清水中，每2天换水一次。
与苹果、香蕉等乙烯释放量大的水果同放会加速发芽，而与洋葱共存可相互抑制。更科学的方式是放入几片新鲜薄荷叶或迷迭香，其挥发性成分能干扰土豆芽眼细胞分裂。测试表明，这种天然抑芽方法可使发芽率降低60%。
日常储存时可选择完整无损伤的土豆，剔除表面潮湿或带泥土的个体。建议每月检查一次储存状态，及时剔除开始变软的土豆。烹饪前注意观察芽眼情况，若已出现小于2毫米的嫩芽，深度挖除芽眼及周围组织后仍可食用，但发芽超过5毫米或表皮发绿时应当丢弃。将土豆制成半成品如切片焯水后冷冻，或加工成土豆淀粉长期保存，也是有效的防芽变通方法。搭配杂粮轮换食用，既能避免囤积，又能保证膳食多样性。
