肛门病毒疣，一般指肛门尖锐湿疣，是由人乳头瘤病毒(HPV)感染引起的皮肤黏膜赘生物。治疗肛门病毒疣有效的方法主要包括药物治疗、物理治疗以及手术治疗等。

药物治疗是肛门病毒疣的常用方法之一。患者可以在医生指导下使用咪喹莫特软膏、鬼臼毒素软膏等外用药物，这些药物能够抑制病毒复制和细胞增殖，从而去除疣体。同时，患者也可以口服抗病毒药物，如干扰素等，以增强免疫力，辅助治疗。但需要注意的是，药物治疗需要一定的时间才能看到效果，并且不同患者的疗效可能有所不同。

物理治疗也是肛门病毒疣的有效治疗方法之一。常见的物理治疗包括激光治疗、冷冻治疗和电灼治疗等。激光治疗利用高强度的激光束直接照射疣体，使其迅速坏死脱落。冷冻治疗则是利用液氮等制冷剂使疣体迅速冷冻并坏死，从而达到去除疣体的目的。电灼治疗则是通过高频电流产生的热量使疣体迅速凝固并脱落。这些物理治疗方法具有疗效快、痛苦小的优点，但需要多次治疗才能达到理想效果。

对于较大或难以用其他方法去除的疣体，可以考虑手术治疗。手术治疗通常包括疣体切除术和刮除术等，通过手术直接切除或刮除疣体。手术治疗的优点是疗效确切，但可能会留下疤痕或色素沉着等后遗症。

除了上述治疗方法外，患者还可以考虑中医治疗。中医治疗以内外结合治疗为主，主要用清热除湿、脱敏止痒的中药口服，同时配合中药外洗或外敷等方法，以促进局部血液循环和病变组织坏死脱落。但需要注意的是，中医治疗需要在专业中医师的指导下进行，以确保治疗效果和健康性。

总之，治疗肛门病毒疣有效的方法包括药物治疗、物理治疗、手术治疗以及中医治疗等。患者应根据自身情况和医生建议选择合适的治疗方法，并在治疗过程中保持积极的心态和良好的生活习惯。