肛门内有疣体时，药物治疗是常用的治疗手段之一。然而，需要注意的是，肛门疣体可能由多种原因引起，如病毒感染（特别是人乳头瘤病毒HPV）、尖锐湿疣等，因此在使用药物前应咨询专业医生，以确保药物对症并遵循正确的用药方法。

以下是一些常用的肛门疣体治疗药物：

咪喹莫特乳膏：咪喹莫特乳膏是治疗肛门疣体的常用药物之一，可用于成人外生殖部位疣和肛门疣、尖锐湿疣。其主要成分咪喹莫特可在局部形成干扰素等多种细胞因子，通过间接抗病毒和免疫调节等方法来达到治好肛门疣的目的。使用时，需将乳膏直接涂抹在患处，并遵循医生的指导进行规范用药。

鬼臼毒素：鬼臼毒素也是一种常用的肛门疣体治疗药物。其通过抑制细胞有丝分裂来使疣体变小消失。在使用时，需将药物涂抹在疣体上，并注意观察病情变化。然而，鬼臼毒素具有一定的刺激性，使用时需避免接触到正常皮肤组织。

抗病毒药物：对于由病毒感染引起的肛门疣体，抗病毒药物也是常用的治疗手段。如阿昔洛韦片、利巴韦林片等，这些药物能够抑制病毒生长，从而改善症状。但具体用药需根据病毒类型和病情严重程度由医生确定。

除了药物治疗外，物理治疗（如冷冻治疗、激光治疗等）和手术治疗也是肛门疣体的有效治疗手段。物理治疗可以通过破坏疣体细胞来达到治疗的目的，而手术治疗则适用于疣体较大或病情较重的患者。

总之，肛门内有疣体时，应根据具体病情和医生建议选择合适的药物进行治疗。同时，保持良好的生活习惯和避免不洁性生活也是预防肛门疣体的重要措施。