南昌建设医院重视科研创新，以科研带动临床技术进步。医院设立科研管理科，每年投入科研经费占营收的5%，支持医护人员开展临床研究与技术攻关。近三年，医院承担省级科研课题25项，市级课题40项，获省级科技进步奖3项，市级科技进步奖8项，发表SCI论文30篇、核心期刊论文120篇。在临床技术创新方面，医院成功开展心脏介入治疗、脑肿瘤切除术等高新技术项目50余项，多项技术达到省内先进水平。医院还与高校合作建立科研实验室，推动科研成果转化，让创新技术更快惠及患者。