辣椒可以通过冷藏、冷冻、晒干、腌制、真空密封等方式延长保存时间。
新鲜辣椒洗净擦干后装入保鲜袋，排出空气扎紧袋口，放入冰箱冷藏室可保存一周左右。冷藏温度控制在4-8摄氏度能有效延缓辣椒腐败，注意避免与其他水分大的蔬菜接触。冷藏前剔除有损伤的辣椒，定期检查袋内是否有冷凝水。
整根辣椒或切块后平铺在托盘冷冻2小时，再转移至密封袋冷冻保存可达半年。冷冻会使辣椒质地变软，更适合后续烹饪使用。冷冻前建议去除辣椒籽和内膜，分装成单次用量避免反复解冻。解冻后的辣椒不宜生食，需加热烹调。
选择完整无伤的辣椒串成挂串，置于通风干燥处晾晒2-3周，完全脱水后装罐密封。晒干过程需避免雨淋和露水，定期翻动保证均匀干燥。干辣椒可研磨成粉或整颗保存，注意防潮防虫，存放阴凉处保质期可达1年。
辣椒洗净晾干后装入消毒容器，按比例加入盐水或醋汁浸泡，密封存放阴凉处。腌制过程中乳酸菌发酵会产生独特风味，开盖后需冷藏。可添加大蒜、花椒等香料增加风味，腌制2周后食用风味更佳，保质期约3个月。
使用真空机抽除包装袋内空气，隔绝氧气延缓氧化变质。真空包装的鲜辣椒冷藏可保存2周，冷冻保存期延长至1年。操作时注意辣椒表面不能有水分，包装袋需选用食品级耐低温材质。真空保存能最大限度保留辣椒的色泽和营养。
不同品种辣椒适合的保存方式有所差异，青椒含水量高更适合冷藏或腌制，红辣椒适合晒干或冷冻。无论采用哪种方法，保存前都需仔细挑选无腐烂、无机械损伤的辣椒，容器要清洁消毒避免微生物污染。少量多次分装能减少开合次数，定期检查保存状态，出现霉变需立即丢弃。合理保存辣椒既能避免浪费，又能随时获取其丰富的维生素C和辣椒素等营养成分。
