红薯储存的关键在于控制温度、避免潮湿和防止损伤。可采用地窖保存、纸箱存放、阴凉通风处悬挂、沙土埋藏、冰箱冷藏等方法延长保鲜期。
传统地窖能维持稳定的低温高湿环境，温度保持在10-15摄氏度，湿度约85%。将完好无损的红薯分层铺放于垫有稻草的架子上，定期检查剔除发芽或霉变个体。地窖需避光且留有通风口，避免二氧化碳积聚导致腐烂。
选择带透气孔的纸箱，内垫报纸或厨房纸吸收潮气。红薯需逐个用软纸包裹隔离，层间用瓦楞纸隔开，存放于家中阴凉角落。此法适合少量储存，注意每月翻检，及时清除表皮出现黑斑的个体。
用网兜或编织袋装红薯悬挂于北向阳台或屋檐下，利用空气流通带走表面水分。储存前须晾晒2-3天促进伤口愈合，悬挂高度需离地1米以上防潮。冬季需注意防冻，气温低于5摄氏度时应转移至室内。
准备干燥的河沙或黄沙，在木箱底部铺5厘米厚沙层，交替摆放红薯和沙土，顶层覆沙10厘米。沙土微潮但不粘手为宜，置于车库或地下室等温度稳定处。此法可隔绝氧气抑制发芽，保存期可达半年。
洗净擦干的红薯用保鲜膜包裹，置于冰箱蔬果舱保持5-8摄氏度。冷藏会延缓淀粉糖化过程，但超过两周可能产生硬芯。食用前需室温回温24小时恢复甜度，已切开的红薯须用真空盒密封防氧化。
储存期间避免水洗破坏表皮保护层，刚收获的红薯需在25-30摄氏度环境下愈伤7-10天促进伤口木栓化。发现霉变应立即隔离，霉变部位产生的甘薯酮毒素耐高温且扩散快。冬季可制作红薯干延长保存，切片蒸熟后60摄氏度烘干至含水量20%以下，密封冷冻可存一年。日常取用遵循先进先出原则，发芽不超过1厘米的红薯去除芽眼仍可食用，但营养价值和口感会下降。
