挑选西红柿时建议选择颜色均匀、表皮光滑、果实饱满且有清香的成熟果实。优质西红柿通常具有果蒂鲜绿、硬度适中、无裂痕或斑点等特征。
颜色均匀的西红柿表明成熟度适中，未成熟或过度成熟的果实可能出现颜色分布不均或发黄现象。自然成熟的西红柿表皮会呈现从果蒂向下的渐变红色，催熟果实则可能出现颜色突兀的过渡。表皮光滑度反映果实生长过程中是否受到病虫害影响，优质西红柿表面不应有凹陷或褶皱。轻轻按压时应有轻微弹性，过硬可能未成熟，过软则可能存放过久。新鲜西红柿带有植物清甜气息，若出现发酵味或异味则可能已变质。
果蒂状态能判断新鲜程度，枯萎发黑的果蒂说明采摘时间较长。中型果实的口感通常优于过大或过小果实，形状畸形可能因生长异常导致。避免选择有明显机械损伤的果实，破损处易滋生细菌。冬季选购时注意果实是否受冻，冻伤西红柿会出现透明状斑块。有机种植的西红柿通常比普通果实更结实，但价格相对较高。
日常储存西红柿建议室温避光放置，未完全成熟的果实可置于纸袋中加速成熟。清洗时用流动清水轻柔搓洗，去除表面农残可先用淡盐水浸泡。脾胃虚寒者不宜空腹食用过多，过敏体质者首次食用需观察反应。烹饪时短时间加热可更好保留维生素C，搭配油脂有助于番茄红素吸收。
