椰子水可以煮着喝，但高温加热可能导致部分营养成分流失。新鲜椰子水含有丰富的钾、镁等电解质和维生素C，直接饮用能更好保留活性成分。若因体质偏寒或特殊需求需加热，建议隔水温热至40度左右，避免长时间煮沸破坏水溶性维生素。
新鲜椰子水中的维生素C和B族维生素对温度敏感，长时间高温会使其分解失效。钾、钠等矿物质虽耐高温，但煮沸后口感会从清甜转为微涩，部分抗氧化成分也会减少。传统海南民间有将椰子水与鸡肉同炖的食疗方，但多选用老椰水而非嫩椰水，因老椰水糖分高、矿物质浓度大，加热后风味更浓郁。
胃肠功能较弱的人群饮用冷藏椰子水可能引发不适，此时隔水加热至体温相近温度即可。需注意市售灭菌包装的椰子水产品多经过巴氏杀菌，重复加热会导致口感变酸。糖尿病患者应控制摄入量，加热浓缩后的椰子水含糖量会相对升高。
椰子水加热后仍可补充电解质，适合运动后脱水或腹泻人群作为天然补液。日常饮用建议优先选择新鲜开口的椰子，开壳后两小时内饮用完毕。若需加热，可加入少许姜片调和寒性，但避免与高蛋白食物同煮以防产生沉淀。特殊人群饮用前建议咨询营养师，根据体质调整饮用方式。
