放鱼苗前可用食盐消毒水体，食盐能抑制部分病原微生物繁殖，但需控制浓度避免刺激鱼体。食盐消毒主要有调节渗透压、抑制细菌繁殖、减少寄生虫附着、促进伤口愈合、改善水质等作用。
食盐通过改变水体渗透压使病原体脱水死亡。淡水鱼苗养殖中常用千分之三至千分之五的食盐浓度，该浓度能破坏单细胞生物的原生质膜，对车轮虫、斜管虫等寄生虫有抑制作用。操作时将食盐均匀溶解后全池泼洒，避免局部浓度过高。
氯化钠可干扰细菌酶系统活性，对嗜水气单胞菌、柱状黄杆菌等常见水产致病菌有抑制作用。短时间浸浴可使用百分之一至百分之三的食盐溶液，持续10-15分钟能降低细菌性烂鳃病、赤皮病的发生概率。消毒后需及时换水避免盐分积累。
食盐能促使鱼体表黏液分泌增加，形成物理屏障阻止小瓜虫、三代虫等寄生虫的附着。针对体表寄生虫感染，可采用百分之一食盐溶液浸浴5分钟，每日重复一次，连续3天。操作时需密切观察鱼苗活动状态，出现浮头应立即停止。
适宜浓度的食盐能收缩鱼体表毛细血管，减少运输或分塘时造成的体表损伤出血。千分之五的食盐溶液可加速鳞片再生，配合维生素E使用效果更佳。消毒时间控制在30分钟以内，水温低于15摄氏度时应适当降低浓度。
食盐能促进有机颗粒絮凝沉降，减少水体浑浊度。每亩水面使用2-3公斤食盐可提高水体透明度，特别适用于新建池塘或暴雨后的水质调节。需注意盐度变化不宜超过千分之一每天，避免鱼苗产生渗透压应激。
食盐消毒需根据鱼苗品种调整浓度，鲤科鱼类耐受性较强，鲑鳟鱼类等对盐分敏感品种应慎用。操作前测量水体pH值，碱性水质中食盐效果会减弱。消毒期间停喂饵料，结束后逐步换水并补充电解多维。定期检测水中氨氮亚盐指标，避免盐分蓄积影响鱼苗生长。新建池塘建议先做小范围试验，确认安全后再全池使用。
