防止土豆发芽长期保存的关键在于控制温度、湿度、光照和通风条件。主要有避光储存、低温干燥、隔绝空气、定期检查、避免混放等方法。
土豆发芽需要光照刺激，建议使用黑色塑料袋或不透光的纸箱存放。地窖、橱柜等阴暗环境更适合长期储存，避免阳光直射或灯光长期照射。储存容器内可垫一层报纸进一步阻隔光线。
将土豆置于10-15摄氏度的环境中能有效延缓发芽，可放入未密封的纸箱置于阳台阴凉处。储存环境湿度需保持在60%-70%，湿度过高易腐烂，可放置食品干燥剂或木炭吸潮。切勿冷藏，低温会促使淀粉转化为糖分影响口感。
将土豆与苹果或香蕉一同存放，水果释放的乙烯气体能抑制土豆芽眼活性。每5公斤土豆配1个苹果，装入打孔塑料袋中保持微量通风。也可用细沙完全覆盖土豆，沙层厚度约5厘米，此法可保存数月不发芽。
每周翻动检查土豆，及时剔除表皮发绿、软化或已冒芽的个体。发芽部位及周围组织会积累龙葵碱毒素，发现芽点需立即挖除周边1厘米厚果肉。轻微腐烂的土豆会加速其他个体变质，需立即隔离处理。
土豆不宜与洋葱、生姜等易挥发物质的食材混存，这类物质会加速土豆代谢。新老土豆应分开放置，陈旧土豆更易发芽。采购时选择表皮完整、无机械损伤的个体，破损处会优先萌发新芽。
储存前无须清洗，表面泥土能保护土豆表皮。少量储存可煮熟后冷冻保存，但口感会变差。发芽严重的土豆禁止食用，龙葵碱毒素高温烹煮也无法完全分解。日常建议根据食用量分批购买，家庭储存量控制在两周内为佳。发现储存环境温度升高时，可将土豆暂时转移至空调房间降温处理。
