鸡蛋壳表面可能存在细菌或污物，建议用流动清水冲洗后擦干或煮沸消毒处理。鸡蛋壳的清洁方式主要有流水冲洗、煮沸消毒、白醋浸泡、小苏打擦拭、紫外线照射。
将鸡蛋置于流动清水下，用手指轻轻搓洗表面残留的粪便或羽毛等污物。注意水流不宜过猛，避免蛋壳破裂。清洗后立即用干净毛巾擦干水分，防止细菌通过气孔渗入蛋内。此方法适用于日常家庭快速清洁。
将鸡蛋放入冷水中加热至沸腾，持续煮1分钟后捞出晾干。高温能有效杀灭沙门氏菌等常见致病菌，但可能破坏蛋壳外层的天然保护膜。该方法更适合用于制作需长期保存的腌渍蛋或需要深度清洁的情况。
用白醋与水按1：3比例混合，将鸡蛋浸泡5分钟。醋酸能溶解钙质沉积物并抑制细菌繁殖，对去除顽固污渍效果显著。操作时需控制浸泡时间，过久可能导致蛋壳变脆。处理后需用清水冲净醋味。
取少量小苏打粉加水调成糊状，用软布蘸取后轻柔擦拭蛋壳。小苏打的微磨蚀性可清除黏附较牢的污垢，同时不会损伤蛋壳结构。处理后的鸡蛋应避开潮湿环境存放，防止残留粉末吸潮影响保存。
使用专业紫外线消毒设备照射鸡蛋表面10-15秒，能灭活绝大部分微生物。需注意紫外线无法去除物理性污渍，且过度照射可能加速蛋品变质。该方法更适用于商业禽蛋加工环节。
日常存放鸡蛋时应保持干燥通风，温度控制在4℃左右可延长保鲜期。烹饪前无论是否清洁外壳，都建议将鸡蛋充分加热至蛋白凝固。婴幼儿、孕妇及免疫力低下人群应避免食用生蛋或半熟蛋制品。若发现蛋壳有明显裂痕或异味，应立即丢弃不再食用。
