紫苏子一般人群均可适量食用，但存在过敏体质、胃肠功能紊乱、阴虚内热、孕妇及婴幼儿等特殊情况时需谨慎。紫苏子含有丰富的不饱和脂肪酸与挥发油成分，可能诱发过敏反应或加重特定体质人群的不适。
紫苏子中的挥发性成分如紫苏醛、柠檬烯等可能引发过敏反应。过敏体质者食用后可能出现皮肤瘙痒、红肿或呼吸道不适等症状。首次尝试紫苏子时应少量测试，观察是否有异常反应。若既往对唇形科植物如薄荷、罗勒等存在过敏史，更需避免食用。
紫苏子富含膳食纤维与油脂，过量摄入可能刺激胃肠黏膜。慢性胃炎、肠易激综合征患者食用后易出现腹胀、腹泻等症状。建议此类人群将紫苏子炒制后研磨成粉，减少对消化道的直接刺激，单日摄入量控制在5克以内。
中医理论认为紫苏子性温味辛，长期过量食用可能加重口干舌燥、潮热盗汗等阴虚症状。更年期女性或肺结核患者等典型阴虚体质人群，应避免将紫苏子作为日常保健食品长期服用。可配伍麦冬、百合等滋阴食材中和其温性。
紫苏子挥发油成分可能通过胎盘影响胎儿发育，孕早期尤其需谨慎。虽有部分地区传统习俗用紫苏安胎，但现代医学建议孕妇每日摄入量不超过3克。妊娠高血压或先兆流产者应完全避免，防止其中活性成分刺激子宫收缩。
3岁以下儿童消化系统发育不完善，紫苏子坚硬外壳存在呛咳风险。其高油脂含量可能加重婴幼儿胃肠负担，引发呕吐或便秘。如需补充α-亚麻酸，建议选择经过脱壳处理的紫苏籽油，且需稀释后少量添加至辅食中。
紫苏子作为药食同源食材，健康人群每日食用量建议控制在10-15克。食用时可搭配粳米煮粥或与核桃共同研磨，提高营养吸收率。储存需密封避光以防油脂氧化，出现哈喇味应立即丢弃。特殊体质者食用前建议咨询中医师或营养师，根据个体情况调整食用方式与剂量。日常饮食中应注意观察身体反应，如出现不适需及时停用并就医。
