辣椒可以通过冷藏、冷冻、干燥、腌制和真空密封等方式储存以保持新鲜。不同储存方法适用于不同使用需求，合理选择能有效延长辣椒的保鲜期。
新鲜辣椒洗净擦干后装入保鲜袋，袋内垫厨房纸吸潮，置于冰箱冷藏室蔬果格。青椒可保存一周左右，红椒因糖分较高易腐坏，建议3-5天内食用。冷藏时注意避免与乙烯释放量高的水果同放，防止加速成熟变质。
整颗辣椒去蒂洗净后擦干水分，平铺冷冻2小时定型再装密封袋，可保存半年。切块辣椒需先焯水30秒灭酶，冰水冷却沥干后分装冷冻。冷冻辣椒适合炖煮类烹饪，解冻后口感变软但不影响风味，维生素C保留率可达60%以上。
线椒等小型辣椒可穿绳悬挂阴干，或切段后50℃低温烘干6-8小时。完全干燥的辣椒需密封防潮，添加食品干燥剂可延长保存期至1年。干辣椒使用前温水浸泡能部分恢复质地，其中辣椒红素和维生素A稳定性较高。
新鲜辣椒用高度白酒消毒后，按1：1比例与白醋或米醋浸泡，添加大蒜和冰糖可提升风味。酸度达4%的泡椒常温保存3个月，开盖后需冷藏。发酵型剁椒需控制盐分在15%以上，装坛时压实密封，避免杂菌污染导致胀罐。
处理干净的辣椒用真空机抽除包装内空气，冷藏条件下保鲜期延长2-3倍。真空包装的整椒需先穿刺表皮防止胀袋，切块辣椒可搭配橄榄油制成油浸辣椒。该方法能最大限度保留辣椒的质构和营养，适合商业批量储存。
储存辣椒时需根据品种特性选择方法，含水量高的彩椒适合冷藏短期保存，厚皮辣椒更适合冷冻或干燥。所有储存前都需剔除病斑损伤的个体，处理过程避免生水残留。日常取用遵循先进先出原则，定期检查储存容器密封性。搭配硅胶干燥剂或脱氧剂能进一步提升防霉效果，但不可直接接触食品。对于已经出现软烂的辣椒应及时丢弃，避免污染其他食材。
