黑芝麻在早晨或下午食用效果较好，这两个时间段更有利于营养吸收和身体利用。黑芝麻的食用效果主要与人体消化吸收节律、与其它食物的搭配、个人体质差异、食用方式以及食用量有关。
早晨人体胃肠功能经过一夜休息后逐渐恢复活跃，消化吸收能力较强。黑芝麻含有丰富的不饱和脂肪酸、维生素E、钙、铁等营养成分，早晨适量食用可以为身体补充能量和营养，有助于维持上午的精神状态。可以将黑芝麻研磨成粉后加入温热的粥或豆浆中食用，研磨后的黑芝麻细胞壁被破坏，其中的营养成分更易被人体吸收。需要注意早晨不宜空腹大量食用黑芝麻，因其脂肪含量较高，空腹食用可能对胃肠产生一定刺激。
下午时段人体代谢仍然较为旺盛，适量食用黑芝麻可以补充能量，缓解午后的疲劳感。黑芝麻中的维生素E和多种矿物质有助于维持身体正常代谢功能。可以将黑芝麻与核桃、红枣等食材搭配制作成糊状食用，既丰富了口感，也增加了营养的多样性。下午食用黑芝麻时应控制食用量，过量食用可能导致热量摄入过多，长期如此可能引起体重增加。
黑芝麻与富含维生素C的食物搭配食用，有助于提高黑芝麻中铁元素的吸收率。例如可以将黑芝麻粉撒在猕猴桃、橙子等水果上食用。黑芝麻与牛奶搭配，可以同时补充钙质和优质蛋白。黑芝麻与核桃搭配，两者都含有丰富的不饱和脂肪酸，对维持心脑血管健康有一定帮助。搭配食用时应注意整体热量控制，避免一次性摄入过多高脂肪食物。
不同体质的人群食用黑芝麻的效果和适宜时间有所不同。消化功能较弱的人群建议在白天食用，避免在晚间食用增加胃肠负担。容易上火的人群应适量食用，黑芝麻性平偏温，过量食用可能加重口干、咽干等不适。对黑芝麻过敏的人群应避免食用，食用后如出现皮疹、瘙痒、呼吸不畅等症状应立即停止食用并及时就医。正在服用某些药物的人群，建议咨询医生后再食用黑芝麻，以免影响药物吸收。
黑芝麻的外壳较硬，整粒食用时人体难以充分消化吸收其中的营养成分。将黑芝麻炒熟后研磨成粉末，或者制作成芝麻糊、芝麻酱等形式，可以提高营养成分的吸收利用率。炒制黑芝麻时应注意火候，避免炒焦产生有害物质。黑芝麻可以加入粥、汤、面点、蔬菜沙拉等多种食物中，增加食物的风味和营养价值。无论采用哪种食用方式，都应注意适量食用，建议每天食用量控制在一小勺左右。
日常饮食中应注意食物多样化，黑芝麻虽营养丰富，但不能替代其它食物。食用黑芝麻的同时应保证蔬菜水果、全谷物、优质蛋白等食物的均衡摄入。适量运动有助于促进新陈代谢和营养物质的吸收利用。保持良好的作息习惯，避免熬夜，有助于维持身体正常的消化吸收功能。如食用黑芝麻后出现任何不适症状，建议及时就医，在医生的指导下进行调整。
