猪肝煮好后建议立即捞出沥干水分，避免长时间浸泡导致营养流失或口感变差。猪肝的保存方式主要有冷藏保存、分装冷冻、真空密封、短期室温存放、酱卤浸泡等。
猪肝含有丰富的蛋白质、铁和维生素A等营养素，长时间泡水会导致水溶性维生素如B族维生素溶解到水中，降低营养价值。煮熟的猪肝质地疏松，持续接触水分会使细胞结构吸水膨胀，影响原有紧实口感。刚煮好的猪肝内部温度较高，若直接浸泡冷水可能因温差过大造成表面紧缩而内部未充分散热。
部分烹饪方式如酱卤猪肝需要保留少量卤汁浸泡，这是为了让调味料持续渗透入味。但普通白煮猪肝若需保持原味，应在煮制完成后用漏勺捞起，平铺厨房纸的容器中摊开晾凉。需要切片食用的猪肝可待其自然冷却至室温后再处理，此时质地会更紧实易于切割。若计划冷藏保存，建议将完全冷却的猪肝用保鲜膜包裹，避免与空气接触产生氧化变色。
新鲜煮制的猪肝建议在2-3天内食用完毕，冷藏保存时注意与其他生食分开存放。食用前可搭配醋蒜汁或柠檬汁帮助铁元素吸收，但肾功能异常者需控制摄入量。日常饮食中每周食用动物肝脏不宜超过100克，同时应搭配富含维生素C的蔬菜水果促进营养利用，高血压患者需注意控制酱卤制品的盐分摄入。
