清洗鸡蛋外壳时可直接用流动清水轻柔搓洗，避免使用洗涤剂或高温水。鸡蛋外壳可能附着沙门氏菌等微生物，但过度清洗会破坏天然保护膜，反而增加污染风险。
日常购买超市预清洁鸡蛋时无须重复清洗，这类鸡蛋已通过专业消毒处理。若鸡蛋外壳有明显污渍或粪便残留，可用软毛刷配合温水快速冲洗，清洗后立即擦干水分并冷藏保存。需注意清洗后的鸡蛋保质期会缩短，应优先食用。
散装土鸡蛋建议烹饪前再清洗，存放时保持干燥通风。沙门氏菌在70℃以上高温环境会被灭活，确保鸡蛋完全煮熟可有效预防食源性疾病。鸡蛋存放时应与其他生鲜食品隔离，避免交叉污染。
鸡蛋储存时建议钝端朝上放置，有助于气室稳定。若发现蛋壳出现裂纹或异味应立即丢弃。合理清洗与储存能最大限度保留鸡蛋营养，优质蛋白、卵磷脂等成分对儿童生长发育和成人健康均有重要价值。
