马蹄可以连皮吃也可以去皮吃，具体选择取决于食用方式与消化能力。马蹄皮含有膳食纤维和部分抗氧化成分，但可能存在泥土残留或口感粗糙的问题。
马蹄连皮食用时需彻底清洗表面泥土和杂质，建议用软毛刷洗后高温蒸煮，高温能有效杀灭寄生虫卵并软化纤维。带皮蒸熟的马蹄口感更绵密，适合制作甜品或炖汤，但胃肠功能较弱者可能出现腹胀。若生食则必须去皮，因表皮可能附着姜片虫等寄生虫，去皮后可直接切片凉拌或榨汁。
去皮马蹄更适合直接生吃或快炒，去皮后草酸含量降低且口感爽脆。但去皮过程会损失部分表皮营养，且马蹄肉暴露后易氧化发黄，建议现削现吃或浸泡淡盐水保鲜。儿童及消化系统敏感人群建议去皮煮熟食用，避免粗纤维刺激肠黏膜。
食用马蹄需注意控制量，每日不超过10颗为宜，避免过量摄入寒性物质引发腹泻。脾胃虚寒者可搭配生姜、红糖烹调中和寒性。挑选时选择表皮完整无霉斑的鲜嫩马蹄，储存时保持干燥通风避免发芽。若出现腹痛、皮疹等过敏症状应立即停食并就医。
