琵琶可以连皮一起吃，果皮含有丰富的膳食纤维和抗氧化物质，但需彻底清洗去除表面农药残留。果肉清甜多汁，果皮微涩带苦，口感差异明显，建议根据个人耐受度选择食用方式。
连皮食用能最大限度保留琵琶的营养价值。果皮中膳食纤维含量高于果肉，有助于促进胃肠蠕动，改善消化功能。果皮表面的天然蜡质层含有黄酮类化合物，具有抗氧化作用，可帮助清除体内自由基。但果皮可能残留种植过程中使用的农药，需用流动清水配合软毛刷反复搓洗，或使用果蔬清洗剂浸泡处理。部分品种果皮较厚且质地粗糙，直接食用可能刺激口腔黏膜。
去皮食用更适合胃肠敏感人群。去除果皮能避免农药残留风险，同时减轻果皮粗纤维对消化道的刺激。果肉含有较多果糖和葡萄糖，升糖指数较高，糖尿病患者应控制摄入量。去皮后的果肉可直接食用，也可制作冰糖炖琵琶等甜品，但高温烹煮会破坏部分维生素C。部分人群食用果皮可能出现舌头发麻等轻微过敏反应，此类情况建议去皮食用。
食用琵琶时建议选择成熟度适中的果实，过生果实酸涩感强，过熟果实易腐败变质。每日食用量控制在200克以内，避免果糖摄入过量。储存时置于阴凉通风处，避免挤压碰撞导致果皮破损。胃肠功能较弱者可先将果肉用温水浸泡片刻再食用，减轻对黏膜的冷刺激。若食用后出现腹痛、皮疹等不适症状，应立即停止进食并咨询医师。
