催熟的水果和自然熟的水果在口感、营养价值和安全性上存在差异，主要区别在于成熟过程和化学成分变化。
自然熟的水果通过自身乙烯激素逐步分解淀粉转化为糖分，果胶酶软化果肉，整个过程与植株养分供给同步。催熟水果采用外源乙烯气体或乙烯利溶液人工干预，快速启动成熟相关酶活性，但脱离母体后无法继续获取养分。
自然熟果实糖酸比更协调，香气物质如酯类、醛类化合物积累充分，果肉质地均匀。催熟水果容易出现表皮着色完全但果肉发硬，部分芒果、香蕉会出现外黄里绿现象，柑橘类可能残留青涩味。
自然成熟过程伴随类胡萝卜素、花青素等抗氧化物质持续合成，维生素C含量达到峰值。催熟水果的酚类物质转化不彻底，猕猴桃等浆果的维生素C含量可能比自然熟低，番茄红素积累不足。
合规催熟使用的乙烯浓度在安全范围内，但个别商贩可能违规使用二氧化硫或石灰水处理，导致硫残留或碱烧伤。自然熟水果无须担心化学残留，但需注意田间农药间隔期是否达标。
催熟水果因呼吸跃变被提前触发，货架期普遍缩短，荔枝等易出现褐变加速。自然熟水果细胞代谢完整，苹果等耐储品种能保持更久新鲜度，热带水果成熟后需尽快食用。
建议消费者根据实际需求选择，即食优先选自然熟，长途运输水果可接受合规催熟。购买时注意观察果蒂是否新鲜、果皮有无药斑，香蕉等催熟水果建议放置通风处散尽残留气体。特殊人群如婴幼儿建议食用充分成熟的水果，糖尿病患者可选择成熟度稍低的水果控制糖分摄入。无论哪种成熟方式，食用前都应充分清洗，热带水果去皮后可减少表皮残留物摄入。
