香蕉存放的最佳方法是将未成熟的香蕉悬挂在阴凉通风处，已成熟的香蕉用保鲜膜包裹根部后冷藏。香蕉保存效果受温度、湿度、成熟度、乙烯接触、机械损伤等因素影响。
未完全成熟的青香蕉适合悬挂在温度15-20摄氏度的通风环境中。用挂钩将整串香蕉茎部朝上悬挂，可减少受压面积，延缓香蕉释放乙烯的速度。避免将香蕉与苹果、梨等乙烯释放量大的水果存放在一起，否则会加速成熟腐烂。厨房背光处或阳台遮阴角落是较理想的悬挂位置。
已出现黄斑的成熟香蕉需用保鲜膜紧密包裹茎部截面，阻断乙烯气体扩散后放入冰箱蔬果室。冷藏温度控制在12摄氏度左右可延缓软化，但果皮仍会变黑，这属于正常现象不影响果肉食用。冷藏保存的香蕉建议3天内食用完毕，低温会导致部分芳香物质流失。
将香蕉从整串中分离可降低互相催熟的概率。单根香蕉用厨房纸包裹后放入透气保鲜盒，置于家中温度相对稳定的储物柜中层。这种方法适合需要分批食用的情况，能保持香蕉约5天处于最佳食用状态，但需每日检查是否有腐烂斑点。
过熟的香蕉可去皮切段后冷冻保存。将果肉平铺在铺有烘焙纸的托盘上预冻2小时，再转入密封袋抽真空保存。冷冻香蕉适合制作奶昔或烘焙食品，保存期可达2个月。冷冻过程会使果肉细胞破裂，解冻后质地变软，不宜直接食用。
临近变质的香蕉可加工成香蕉干、果酱或香蕉泥。切片香蕉用柠檬汁浸泡后60摄氏度低温烘烤6小时制成香蕉干；熟透香蕉加糖熬煮可延长保存期1个月。加工过程会损失部分维生素B6和钾，但膳食纤维和碳水化合物能得到较好保留。
日常存放香蕉应避免阳光直射和高温环境，购买时选择果柄青绿、表皮无擦伤的香蕉更耐储存。可将不同成熟度的香蕉分开放置，按先熟先吃的原则消耗。香蕉与柑橘类水果同放能减缓成熟速度，但不可与土豆等根茎类蔬菜混放。若发现果肉发黑变味应立即丢弃，霉变香蕉产生的展青霉素高温也无法分解。合理保存的香蕉能最大限度保留钾、维生素B6及天然糖分，适合作为运动后的电解质补充食物。
