咖啡渣发酵通常可采用堆肥法或密封发酵法，简单易行且能有效转化有机质。发酵过程需控制湿度、温度及通风条件，避免霉变或异味产生。
堆肥法适合户外空间较大场景。将咖啡渣与枯叶、碎纸板等碳源材料按1：3比例混合，定期翻堆保持透气性，夏季约2-3周可完成发酵。注意堆体高度不超过1米，过湿时可添加木屑调节。此方法能获得疏松肥沃的腐殖土，适合用于花卉栽培。
密封发酵适合家庭小规模处理。咖啡渣装入带透气孔的容器中，混合等量稻壳或椰糠，覆盖纱布存放于阴凉处。每周搅拌一次并观察湿度，若出现白毛属正常菌丝，发黑结块则需重新调整配比。该方法约4-6周可获得酸性改良土，特别适合喜酸植物使用。
发酵完成的咖啡渣应呈深褐色团粒结构，无刺鼻异味。使用前建议摊开晾晒杀菌，盆栽施用比例不超过土壤总量的20%。避免直接接触植物根系，可作表层覆盖物或与基肥混合。未完全发酵的咖啡渣可能抑制种子发芽，建议优先用于多年生植物。定期使用能改善土壤板结，但需注意监测土壤pH值变化。
