苹果可通过低温冷藏、控制湿度、单独存放、避免损伤、使用保鲜袋等方式延长储存时间。
将苹果放入冰箱冷藏室可有效延缓成熟过程。温度保持在0-4摄氏度时，苹果呼吸作用减弱，乙烯气体释放减少，能维持较长时间的新鲜度。冷藏前需确保苹果表面干燥，防止冷凝水导致腐烂。家用冰箱蔬果保鲜区是最佳存放位置，避免与冷冻室过近导致冻伤。
储存环境湿度控制在90%左右最为理想。湿度过低会导致苹果失水皱缩，湿度过高易滋生霉菌。可在保鲜袋内垫入干净纸巾吸收多余水分，或放置食品级干燥剂调节湿度。整箱储存时可覆盖微孔保鲜膜保持适度透气性。
苹果应与其他果蔬分开存放，特别是香蕉、猕猴桃等乙烯释放量大的水果。乙烯会加速苹果后熟和软化过程。不同品种的苹果也建议分装储存，早熟品种与晚熟品种对乙烯敏感度存在差异。储存容器选用透气的竹篮或塑料筐优于密闭塑料袋。
储存前需仔细检查并剔除有磕碰、虫蛀或腐烂的苹果。轻微损伤的果实在储存期间会释放更多乙烯，并成为霉菌入侵的突破口。搬运时轻拿轻放，运输途中可用泡沫网套保护。储存容器内壁应光滑无毛刺，防止刮伤果皮。
专用果蔬保鲜袋能调节氧气与二氧化碳浓度，抑制苹果呼吸作用。选择具有微孔结构的PE材质保鲜袋，每袋装入10-15个苹果为宜，保留三分之一空间保持空气流通。袋口可折叠后用夹子固定，每周开袋通风换气一次。
储存期间定期检查苹果状态，及时剔除变质果实。食用前将冷藏的苹果置于室温下2小时风味更佳。冬季可放在阴凉通风处储存，夏季建议优先冷藏。有机苹果因无防腐剂处理更需注意储存条件。搭配苹果醋或柠檬汁浸泡能短期防止切面氧化，但完整储存才能最大限度保留营养。
