谷氨酰胺不适合肝肾功能不全者、严重代谢性疾病患者、孕妇及哺乳期女性、对成分过敏者以及特定疾病急性期患者使用。谷氨酰胺作为条件性必需氨基酸，虽有助于肠道修复和免疫力提升，但部分人群可能因代谢障碍或特殊生理状态引发风险。
谷氨酰胺代谢需通过肝脏和肾脏完成，肝肾功能不全者可能因代谢能力下降导致血氨升高。肝功能衰竭患者补充谷氨酰胺可能诱发肝性脑病，慢性肾病患者过量摄入可能加重氮质血症。此类人群使用前需严格评估肝肾指标，并在医生指导下调整剂量。
糖尿病酮症酸中毒、遗传性代谢缺陷患者应慎用谷氨酰胺。谷氨酰胺在体内可转化为葡萄糖，可能干扰血糖控制。部分代谢疾病如尿素循环障碍患者无法正常代谢谷氨酰胺分解产生的氨，可能引发高氨血症等并发症。
目前缺乏足够证据证明谷氨酰胺对胎儿及婴儿的安全性。孕期补充可能影响胎盘氨基酸转运平衡，哺乳期使用可能通过乳汁影响新生儿代谢。建议通过天然食物如鸡蛋、鱼肉获取必需氨基酸，避免额外补充制剂。
部分人群可能对谷氨酰胺辅料如麦芽糊精、二氧化硅等产生过敏反应，表现为皮疹、呼吸困难等症状。使用前应仔细阅读成分表，首次补充建议从低剂量开始观察耐受性，出现过敏症状需立即停用。
重症胰腺炎、严重感染等疾病急性期可能出现谷氨酰胺代谢紊乱。此时补充可能加重氧化应激反应，甚至导致多器官功能障碍。临床研究显示，危重症患者静脉补充谷氨酰胺可能增加死亡率，须由医生评估风险收益比。
健康人群长期服用谷氨酰胺也需注意每日摄入量不超过30克，避免引发胃肠不适。建议优先通过高蛋白食物如瘦肉、豆制品获取谷氨酰胺，特殊人群使用前应咨询营养师或合并用药者需注意谷氨酰胺可能影响抗癫痫药、化疗药物疗效，需间隔2小时以上服用。日常饮食中乳制品、蘑菇等天然食材含有适量谷氨酰胺，可作为安全补充来源。
