干香菇保存的关键在于防潮、避光和密封，采用真空分装、冷藏储存、干燥剂辅助、定期晾晒和隔绝异味五种方法可有效延长保质期。
将干香菇按每次用量分装至食品级真空袋中，抽真空后密封。真空环境能隔绝氧气和水分，防止霉菌滋生。分装后每次取用只需打开单次用量，避免反复开袋导致剩余香菇受潮。真空包装的干香菇在常温下可保存12个月以上，品质基本不变。
未开封的整包干香菇建议放入冰箱冷藏室，温度控制在4℃左右。低温能显著抑制微生物活动，保持香菇的鲜香物质不挥发。需注意从冰箱取出后需静置至室温再开袋，防止冷凝水渗入。冷藏保存的干香菇保质期可达18个月，特别适合南方潮湿地区。
在储存容器底部铺上食品级硅胶干燥剂，再放入干香菇密封。干燥剂能持续吸收环境中的游离水分，维持容器内相对湿度低于50%。建议每月检查干燥剂颜色变化，变红后需及时更换。此法可使干香菇在梅雨季节仍保持酥脆状态。
已开封的干香菇每2个月需摊开晾晒1次，选择干燥通风处晾晒2小时。阳光中的紫外线有杀菌作用，能消除储存过程中产生的微量霉菌孢子。晾晒后需彻底冷却再重新密封，此法尤其适合没有真空设备的家庭。
干香菇需单独存放，避免与香料、海鲜等气味强烈的食材混放。香菇的多孔结构易吸附异味，建议使用带密封圈的玻璃罐储存。储存容器使用前可用茶叶水煮沸消毒，彻底晾干后再放入香菇，能有效预防串味问题。
日常保存干香菇时建议优先选择厚实完整的菌盖，这类香菇组织结构致密更耐储存。储存环境温度建议保持在25℃以下，湿度不超过60%。可定期检查香菇状态，优质干香菇应保持菌褶金黄、菌盖边缘内卷、折断时有清脆响声。若发现霉斑或虫蛀需立即丢弃，不可食用。食用前用温水泡发时，可加入少量白糖加速软化，泡发后的香菇水富含鲜味物质，可用于提鲜调味。冬季可将干香菇悬挂于暖气片附近，利用热空气循环保持干燥，但需注意避免高温烘烤导致营养流失。
