蓝莓保存的关键在于控制水分和温度，可采用冷藏、冷冻或干燥储存等方法延长保鲜期。
新鲜蓝莓放入透气的食品盒中，垫一层厨房纸吸收冷凝水，置于冰箱冷藏室4℃左右可保存5-7天。注意清洗后必须彻底晾干再冷藏，带水分的蓝莓易发霉变质。冷藏期间每日检查剔除软化或渗汁的果实，避免交叉污染。
将完整无破损的蓝莓平铺在烤盘急冻2小时，冻硬后装入密封袋排出空气，-18℃冷冻可储存8-12个月。冷冻会使果皮变软但不影响营养价值，适合用于制作奶昔或烘焙食品。解冻时建议直接使用无须回温，避免反复冻融。
用食品烘干机60℃处理6-8小时制成蓝莓干，或选择自然晒干方式。脱水后的蓝莓需密封避光保存，添加脱氧剂可延长至6个月以上。干燥过程会损失部分维生素C，但花青素和膳食纤维保留较完整。
采用真空机抽除包装内空气，配合冷藏可保鲜2-3周。此方法能有效抑制霉菌和氧化，适合短期保存大量蓝莓。需注意真空包装可能挤压果实，建议选择硬质容器抽真空。
通过熬煮制作蓝莓酱或果醋，高温灭菌后密封保存可达1年。自制果酱糖度应超过60%才能抑制微生物，添加柠檬汁有助于保持色泽。此方法会改变蓝莓原有口感，但便于长期保存和多样化食用。
蓝莓含有丰富花青素和维生素，储存过程中应避免阳光直射和高温环境。购买时选择果粉完整、硬度适中的新鲜果实，不同成熟度的蓝莓建议分开存放。日常取用遵循先进先出原则，冷冻蓝莓可直接加入燕麦粥或酸奶食用，最大限度保留营养成分。若发现霉变或异味应立即丢弃，不可去除霉变部分后继续食用。
