干木耳一般用冷水浸泡3-4小时最佳，温水浸泡需1-2小时。泡发时间主要受水温、木耳厚度、食用方式等因素影响。
冷水泡发能最大限度保留木耳的胶质和营养成分，水温不超过30度时，厚片木耳需浸泡4小时左右，薄片木耳约3小时即可充分吸水膨胀。冷水泡发的木耳口感更为爽脆，适合凉拌或快炒。需注意夏季室温过高时，应放入冰箱冷藏泡发以避免细菌滋生。
40度左右的温水可缩短泡发时间，厚木耳约需2小时，薄木耳1小时即可。温水会使部分胶质溶解，更适合用来煲汤或炖煮。切忌使用超过50度的热水，高温会破坏木耳多糖结构，导致营养流失且口感变黏。泡发过程中建议每半小时换一次水。
野生木耳通常比人工栽培的更厚实，泡发时间需延长半小时至1小时。单片厚度超过3毫米的木耳，建议撕成小块后再浸泡。若发现木耳中心仍有硬芯，可延长浸泡时间，但总时长不宜超过8小时，避免产生有害物质。
用于凉拌的木耳需完全泡发至原有3倍大小，确保口感脆嫩。炖汤用的木耳可保留少许韧性，泡发至2倍大小即可。制作馅料时，可将泡发好的木耳焯水1分钟进一步软化。油炸前需彻底沥干水分，防止油溅。
优质干木耳泡发后应呈黑褐色半透明状，无杂质和异味。若浸泡后体积增大不足2倍，可能经过化学处理。正常泡发水呈浅琥珀色，若水色异常发黑或发红需停止食用。泡发24小时以上的木耳会产生米酵菌酸毒素，务必丢弃。
泡发好的木耳可冷藏保存2-3天，建议按需泡发。烹饪前用流水冲洗褶皱处，去除残留泥沙。胃肠功能较弱者应控制食用量，避免一次超过50克干品。搭配胡萝卜、西蓝花等富含维生素C的蔬菜，有助于提高木耳中铁元素的吸收率。出现腹胀等不适症状时，可饮用生姜红枣水缓解。
