果酱一般建议趁热装瓶，有助于延长保存时间并减少细菌污染风险。果酱制作完成后温度较高时直接装瓶，可以形成更好的密封效果，同时高温能抑制微生物繁殖。
果酱趁热装瓶时，高温状态下的果酱流动性更好，能够充分填满容器空间，减少瓶内空气残留。装瓶后立即密封，冷却过程中瓶内会形成负压，进一步增强密封性。这种方法能有效隔绝外界空气和微生物，避免果酱发霉变质。常见的高酸度果酱如草莓酱、蓝莓酱等，酸度本身具有一定防腐作用，配合热装瓶可保存数月。
部分特殊配方的低糖或低酸果酱可能不适合热装瓶。这类果酱因糖分或酸度不足，高温装瓶反而可能加速变质。制作时若添加了新鲜香草、乳制品等不耐热成分，高温会导致风味改变或分层。此类情况建议将果酱冷却至室温再装瓶，并冷藏保存短期内食用。采用巴氏杀菌处理的果酱也可选择冷装瓶方式，但需确保容器严格消毒。
制作果酱时需根据配方特性选择装瓶方式，高糖高酸果酱优先热装瓶，装瓶前要对容器煮沸消毒。无论采用哪种方式，装瓶后都应倒置几分钟利用余热杀菌瓶盖区域。储存时应放置阴凉避光处，开封后需冷藏并尽快食用。若发现果酱出现霉斑、胀瓶或异味应立即丢弃。
