新鲜蘑菇在冰箱冷藏条件下通常可以保存3-7天。保存时间受蘑菇种类、储存方式、新鲜程度、冰箱温度、包装方法等因素影响。
新鲜蘑菇水分含量高且组织娇嫩，冷藏时需保持干燥透气。未清洗的整颗蘑菇用牛皮纸袋或透气保鲜盒存放，避免密封塑料袋导致水汽凝结加速腐败。口蘑、金针菇等菌柄较长的品种可直立放置于容器中，平菇等伞状菌类需单层平铺。若发现蘑菇表面出现黏滑或发黑斑点，应立即丢弃不可食用。
部分特殊品种如松茸、牛肝菌等风味物质易挥发，建议2-3天内食用完毕。经过焯水处理的蘑菇可沥干水分后冷冻保存，保质期可延长至1个月，但解冻后口感会变软。商业预包装的蘑菇应遵循包装标注的保质期，开封后需转移至透气容器存放。
储存期间定期检查蘑菇状态，烹饪前简单冲洗即可，避免长时间浸泡。建议购买时选择菌盖紧实、菌褶洁白的新鲜蘑菇，少量多次购买更能保证品质。可将蘑菇与洋葱、大蒜等天然抗菌食材分开放置，不宜与高乙烯水果同储。若需长期保存，可考虑晒干、油浸或制成蘑菇酱等加工方式。
