煮好的汤圆可以通过冷藏或冷冻保存防止粘连，关键需控制水分和隔离措施。主要有密封冷藏、冷冻保存、油膜隔离、淀粉包裹、分装存放五种方法。
将煮熟的汤圆沥干水分后放入保鲜盒，盒底垫一层食品级硅油纸或保鲜膜，汤圆之间保留空隙避免挤压。冷藏温度控制在4度左右可保存1-2天，食用前用沸水快速复热10秒即可恢复口感。冷藏适合短期保存且能较好保持汤圆柔软度，但需注意密封性避免串味。
汤圆完全冷却后平铺在撒有糯米粉的托盘上急冻1小时定型，再转移至密封袋抽真空保存。冷冻状态下淀粉不易老化，可存放15-30天。复热时无需解冻直接沸水煮制，冷冻形成的冰晶层能有效阻隔汤圆表皮粘连。此方法适合长期保存但可能略微影响表皮弹性。
熟汤圆沥水后趁热薄刷一层熟油，玉米油或椰子油等气味清淡的油脂为佳。油脂能在表皮形成疏水膜，冷却后装入透气性好的竹制容器。室温下可放置4-6小时不粘连，适合待客时临时摆放。注意油量过多会影响口感，建议使用烘焙刷均匀涂抹。
将冷却至温热的汤圆滚上糯米粉或木薯淀粉，粉层吸收表面水分形成防粘屏障。处理后的汤圆可叠放2-3层，每层用烘焙纸间隔。此方法保存的汤圆需蒸热食用，煮制会导致粉层脱落。淀粉包裹能维持8-12小时不粘，适合早餐提前准备。
按单次食用量将汤圆分装在食品级PP分格盒中，每个格子放置3-4颗汤圆，注入凉开水完全浸没后密封。水分子阻隔使汤圆相互隔离，冷藏可存3天，食用时倒掉水直接加热。此法能最大限度保持形状完整，但长时间浸泡可能使表皮略微发胀。
保存汤圆时需注意刚煮好的汤圆要彻底沥干再处理，所有容器使用前需高温消毒。复热时冷冻汤圆建议用蒸笼避免破皮，冷藏汤圆可用微波炉中火加热20秒。传统水磨糯米粉制作的汤圆比速冻汤圆更易粘连，建议优先选择冷冻保存。若发现汤圆表面出现黏液或酸味应立即丢弃，变质的糯米制品可能引发胃肠不适。日常食用建议现煮现吃，保存后的汤圆口感会略有下降。
