鹿鞭通常建议研磨成粉后温水冲服或泡酒饮用，效果较佳。鹿鞭的食用方式主要有研磨冲服、泡酒饮用、炖汤食用、配伍药材、制成胶囊。
将干燥鹿鞭研磨成细粉，每日取少量用温水送服。这种方式能最大限度保留有效成分，便于人体吸收。鹿鞭粉含有丰富的蛋白质、氨基酸及微量元素，适合体质虚弱、肾阳不足者。注意初次服用应从小剂量开始，观察身体反应。阴虚火旺者慎用。
整根鹿鞭浸泡于高度白酒中，密封存放一个月后饮用。酒精有助于析出鹿鞭中的脂溶性活性物质，每日饮用不超过50毫升。此法适合中老年男性改善腰膝酸软，但高血压、肝病患者不宜。泡制时可加入枸杞、人参等药材增强效果。
鹿鞭切片后与鸡肉、猪骨等食材慢炖2-3小时，汤肉同食。高温炖煮能使胶原蛋白溶出，适合术后体虚者滋补。建议搭配山药、当归等平补药材，避免与辛辣调料同用。每周食用1-2次为宜，儿童及孕妇不宜。
鹿鞭可与肉苁蓉、巴戟天等补肾药材共同煎煮，增强温阳效果。传统中医方剂中常将鹿鞭与熟地黄、山茱萸配伍，用于肾阳亏虚引起的畏寒肢冷。需由中医师根据体质辨证配比，避免自行混用引起上火。
现代工艺将鹿鞭提取物制成胶囊剂型，便于定量服用。这种方式能规避腥味，适合对口感敏感者。选择正规厂家生产的鹿鞭胶囊，注意查看成分表中是否添加激素类物质。服用期间忌食萝卜、浓茶等解药食物。
食用鹿鞭需注意体质辨证，阳虚者适宜而阴虚火旺者忌用。建议在中医师指导下确定剂量和疗程，避免长期过量服用。日常可配合艾灸命门穴、适度运动来增强效果。储存时应置于阴凉干燥处，防潮防蛀。出现口干舌燥等上火症状时应立即停用，儿童青少年及高血压患者慎用。冬季进补效果优于夏季，连续服用不宜超过三个月。
