长效避孕药在正确使用下能有效避孕并可能带来额外健康益处，但也存在一定副作用风险。长效避孕药主要通过抑制排卵、改变子宫内膜环境及宫颈黏液性质实现避孕，部分类型可能改善痛经、降低卵巢癌风险。
长效避孕药中的孕激素成分可规律月经周期，减少经血量，对子宫内膜异位症或功能性子宫出血患者有治疗作用。含炔雌醇的复方制剂能维持雌激素水平，预防骨质疏松，部分研究显示使用超过5年可能使卵巢癌风险降低。左炔诺孕酮宫内缓释系统可局部作用，减少全身激素暴露，适合哺乳期女性。
部分使用者可能出现突破性出血、乳房胀痛等短期反应，长期使用可能增加静脉血栓概率，35岁以上吸烟女性风险更显著。少数人会出现情绪波动、体重增加，含雄激素活性孕激素的制剂更易引发痤疮。有家族性乳腺癌病史或严重偏头痛者需谨慎评估。
使用前需排除妊娠及激素依赖性肿瘤病史，服药期间建议每年进行乳腺和宫颈检查。突发剧烈头痛或胸痛需立即就医。可与医生讨论个体化方案，如对合成激素敏感者可选择低剂量制剂，有血栓风险者考虑孕激素单药。健康生活方式如补充叶酸、定期运动能帮助降低潜在风险。
