新鲜辣椒可通过冷冻、晾晒、油浸、盐渍、真空密封等方式长期保存。不同保存方法适用于不同烹饪需求，合理选择可最大限度保留辣椒的营养和风味。
将完整辣椒洗净擦干后直接放入密封袋冷冻，可保存半年以上。冷冻会改变辣椒质地，适合后续炖煮或打碎使用。红辣椒冷冻后颜色更鲜艳，青椒冷冻可能出现轻微褐变。冷冻前去除辣椒蒂可减少水分聚集。
用棉线串起辣椒悬挂通风处自然风干，或使用食品烘干机脱水。完全干燥的辣椒可研磨成辣椒粉，或整颗保存1年以上。晾晒过程中需避免潮湿环境导致霉变，定期翻动确保均匀脱水。日晒法需避开正午强光以免营养流失。
将辣椒切片后完全浸没在食用油中，可冷藏保存3个月。橄榄油或菜籽油能有效隔绝空气，同时赋予油脂辣味。使用前需确保容器消毒干燥，油面需完全覆盖辣椒。此法保存的辣椒适合拌凉菜或制作辣椒油。
按辣椒重量10%的比例加盐腌制，压重物排出空气后密封。高盐环境可抑制细菌，保存期达1年。食用前需浸泡脱盐，适合制作泡椒或炒制川湘菜。注意使用陶瓷或玻璃容器，避免金属容器腐蚀。
使用真空机抽除包装内空气，冷藏可保鲜2个月以上。此法最大程度保留新鲜辣椒的脆度和维生素C含量。适合保存彩椒等厚肉品种，薄皮辣椒可能因负压变形。真空包装后仍建议冷藏避光保存。
根据辣椒品种和用途选择合适保存方式，红辣椒适合干制，青椒更适合冷冻。无论采用哪种方法，保存前需剔除病斑损伤的辣椒，确保容器清洁干燥。少量多次分装可避免反复解冻或开封导致的变质。长期保存的辣椒维生素含量会逐步下降，建议半年内食用完毕。搭配大蒜、生姜等配料共同保存可提升风味层次，但需注意配料各自的保存特性。
