绿豆芽可以通过低温冷藏、避光保存、保持干燥、减少挤压、密封储存等方式延长保鲜期。
将绿豆芽放入保鲜袋中，排出多余空气后扎紧袋口，置于冰箱冷藏室4摄氏度左右的环境中。低温能有效抑制微生物繁殖，延缓豆芽呼吸作用导致的养分消耗。注意不要将豆芽贴近冰箱后壁，避免冻伤导致细胞破裂出水。
绿豆芽应存放在不透光的容器或橱柜内，光照会加速叶绿素合成导致豆芽纤维化。可用深色保鲜盒盛装，或在透明容器外包裹铝箔纸。紫外线还会促进维生素C氧化流失，避光可保留更多营养成分。
清洗后的豆芽需彻底沥干水分，用厨房纸吸干表面水珠后再储存。潮湿环境易滋生腐败菌，建议在容器底部垫吸水性好的纱布或纸巾。若发现袋内有冷凝水珠，应及时更换干燥的保鲜袋。
储存时避免堆放过高或重物压迫，豆芽组织娇嫩易因机械损伤引发褐变。最好平铺单层存放，如需叠放应在每层之间用镂空隔板分隔。运输过程中使用带透气孔的硬质容器保护。
使用真空密封盒或抽真空保鲜袋能隔绝氧气，延缓氧化变质。普通保鲜袋需尽量排出空气后密封，开口处可用橡皮筋加固。密封前可放入少量食品干燥剂吸收多余水分。
新鲜绿豆芽含有丰富维生素B族和膳食纤维，建议购买后尽快食用。如需短期保存，可将其浸泡在清水中冷藏，每日换水1-2次。发芽过程中使用的器具要定期消毒，避免交叉污染。出现黏液、异味或褐变时应立即丢弃，不可继续食用。日常可将豆芽与胡萝卜丝、木耳等搭配凉拌，或快速清炒保留脆嫩口感。
