绿豆芽在冰箱冷藏条件下一般可以保存2-3天，实际保存时间受储存温度、湿度、包装方式、新鲜程度和是否清洗等因素影响。
绿豆芽适合在0-4摄氏度的低温环境中保存，高温会加速其呼吸作用和水分流失。家用冰箱冷藏室温度若保持在4摄氏度以下，可有效延缓豆芽变质。若室温超过20摄氏度，豆芽可能在12小时内出现萎蔫或发黏。
绿豆芽含水量达90%以上，需维持85%-95%的高湿度环境。用保鲜袋密封保存时，可垫入湿润厨房纸吸收多余水分，避免袋内积水导致腐烂。未密封的豆芽在干燥环境中易失水变黄。
带孔保鲜盒能平衡透气与保湿，比完全密封的塑料袋更利于延长保鲜期。购买时的原包装若为透气膜，建议保留原包装放入冷藏。真空包装的豆芽保质期可延长至5天左右。
刚采摘的绿豆芽根须洁白、芽体挺直，冷藏保存时间较长。若购买时已有褐色斑点或异味，即使冷藏也会在1天内变质。豆芽茎部发红或出现黏液时不可食用。
未清洗的带根豆芽比水洗过的更耐储存。若已清洗，需彻底沥干水分并用离心脱水机去除表面水膜。清洗会破坏豆芽保护层，加速微生物繁殖，建议食用前再清洗。
建议将绿豆芽置于冰箱冷藏室下层抽屉，避免与苹果、香蕉等释放乙烯的水果同放。每日检查豆芽状态，出现酸味或滑腻感立即丢弃。短期不食用可焯水后冷冻，但口感会变软。凉拌食用时建议现买现吃，烹饪前用淡盐水浸泡10分钟可杀菌。豆芽富含维生素C和膳食纤维，变质后营养价值大幅下降且可能滋生致病菌，不建议食用隔夜凉拌豆芽。
