木瓜可以通过冷藏、切块冷冻、制作果酱、悬挂阴凉处、包裹报纸等方式长期保存。
成熟木瓜可放入冰箱冷藏层保存，温度控制在5-8摄氏度为宜。冷藏前用厨房纸包裹木瓜表面吸收水分，再装入保鲜袋密封，避免与其他水果接触。冷藏保存可维持木瓜口感3-5天，适合短期储存。
将木瓜去皮去籽后切块，平铺在保鲜盒或密封袋中冷冻。冷冻前可撒少量柠檬汁防止氧化，-18摄氏度以下冷冻可保存2-3个月。解冻后质地变软，适合制作奶昔或甜品，不建议直接鲜食。
木瓜果肉加糖熬煮成果酱，糖分浓度达到60%以上可抑制细菌。装瓶时趁热密封，未开封状态下常温保存6个月，开封后需冷藏并在1个月内食用完毕。添加柠檬汁或维生素C可增强抗氧化效果。
未完全成熟的青木瓜可用网兜悬挂在通风阴凉处，避免阳光直射。定期检查软化程度，此方法可延缓后熟1-2周。与苹果或香蕉分开存放，避免乙烯气体加速成熟。表皮出现黑斑需立即处理。
单个木瓜用干燥报纸包裹2-3层，放入纸箱置于15-20摄氏度环境。报纸可吸收多余水分并调节湿度，定期更换防止霉变。此法适用于硬度较高的半熟木瓜，保存期约7-10天，需每天检查成熟度。
长期保存木瓜需根据食用计划选择合适方法，冷冻和加工适合批量处理，冷藏适合即食需求。无论采用何种方式，保存前都应剔除表皮损伤的果实，处理工具需清洁消毒。建议优先食用新鲜木瓜以获取完整营养，保存过程中维生素C和部分酶活性会逐渐流失，可搭配其他水果补充营养。日常存放避免与释放乙烯的水果同置，定期检查防止腐败变质影响其他食材。
