蓝莓可以冷冻保存，冷冻前需清洗晾干并分装密封。主要有整颗冷冻、糖渍冷冻、果泥冷冻、真空冷冻、烘焙后冷冻五种方法。
将新鲜蓝莓用流水轻柔冲洗后铺在厨房纸上吸干水分，平铺在托盘上放入冰箱冷冻室预冻两小时。待蓝莓表面结霜变硬后转移至密封袋，挤出空气后标注日期冷藏。这种方法能最大限度保留蓝莓完整形态，解冻后适合直接食用或装饰甜品，但表皮会略微变软。
按蓝莓重量添加适量白糖轻轻拌匀，静置半小时待果胶析出后装入密封容器。糖分能降低冰点形成保护层，减缓冰晶对果肉的破坏，解冻后浆果形态饱满多汁。适合用于制作果酱、馅料或酸奶topping，但糖尿病患者应控制用量。
将蓝莓用料理机打碎后过筛去籽，加入柠檬汁防止氧化，按每次用量分装进冰格或小容器。冷冻蓝莓泥可保存六个月，适合制作思慕雪、婴儿辅食或烘焙原料，营养成分更易吸收。注意解冻后需尽快使用，避免反复冻融。
使用真空密封机抽除包装内空气后冷冻，能有效防止冻伤和氧化变质。真空包装的蓝莓可保存十个月以上，适合大量囤货，开封后需一次性用完。这种方法成本较高但保鲜效果最好，解冻后口感接近新鲜蓝莓。
将蓝莓制成马芬、司康等烘焙品冷却后密封冷冻，食用前复烤即可。淀粉类外壳能保护果肉结构，适合作为应急早餐或茶点，保存期三个月左右。注意含乳制品成分的糕点不宜久存，建议分小块包装避免解冻浪费。
冷冻蓝莓前注意挑选无破损的果实，清洗时不要浸泡以免吸水爆裂。密封容器建议选择食品级PE材质，每份控制在200克以内方便取用。解冻时移至冷藏室缓慢化冻能减少汁液流失，已解冻蓝莓须24小时内食用完毕。日常可将冷冻蓝莓加入燕麦粥补充花青素，或与香蕉打成果昔作为运动后补给，但胃肠敏感者避免空腹食用冷食。
