菠萝蜜带把的一端通常是头部，不带把的一端是尾部。菠萝蜜的头部连接果柄，质地较硬；尾部相对圆润，是果实自然生长的末端。
菠萝蜜的头部由于连接果柄，通常会有木质化的硬梗残留，表皮纹理也可能更密集。这一端在采摘时受力集中，可能留下轻微凹陷或疤痕。尾部的果皮相对光滑完整，是花朵脱落后形成的自然收口，部分品种尾部会呈现星状纹路。头部朝上生长时接受更多阳光照射，可能比尾部颜色略深，但甜度分布无明显差异。
少数品种或因生长环境差异可能出现头部与尾部特征不典型的情况。例如雨水过多可能导致尾部膨大变形，病虫害侵袭会使头部疤痕扩大。个别畸形果实可能出现双头或无把现象，这类果实通常因发育异常被淘汰。商业种植中会对果实进行分级筛选，消费者购买时可通过把柄残留和果形对称性辅助判断。
挑选菠萝蜜时可观察把柄新鲜度判断采摘时间，带把处干燥皱缩可能存放较久。存储时建议将头部朝上放置，避免尾部受压开裂。食用前用食用油涂抹刀具可防止果胶粘黏，果肉靠近头部处纤维稍多，可适当削薄。对菠萝蜜过敏者应避免接触果皮黏液，处理时建议佩戴手套。
