大葱可以放冰箱保存，但更适合阴凉通风处存放。短期冷藏可延缓水分流失，长期冷藏易导致冻伤腐烂。保存方式主要有整根包裹冷藏、切段冷冻、土埋保鲜、悬挂阴干、根部水养等。
整根大葱用厨房纸包裹后装入保鲜袋冷藏，可存放一周左右。冷藏时注意不要清洗，保持干燥避免腐烂。葱白部分耐寒性较强，但葱叶在低温下容易冻伤变软，建议将葱叶部分露出袋口透气。若需长期保存，可将葱切段后装入密封盒冷冻，使用时无需解冻直接入锅。
传统土埋法适合大量储存，将带根大葱斜插在湿润沙土中，置于阳台或地下室阴凉处，可保鲜一个月以上。悬挂阴干法适用于干燥地区，将葱捆扎成束倒挂在通风背光处，待外皮干枯后取下，使用时浸泡恢复。根部水养法适合短期保存，像插花般将葱根浸入浅水容器，每日换水可维持一周新鲜度。
大葱含有挥发性硫化物，冷藏时需单独存放避免串味。冷冻保存会改变质地，更适合用于炖煮类菜肴。无论采用何种方式，都应定期检查剔除腐烂部分。保存前无须去除外层老皮，其天然保护层能减少水分蒸发。冬季室外温度低于5度时，可直接将大葱埋于朝北阳台的雪堆中保存，这种传统方法能最大限度保留辛辣风味。
