豆腐变味后不建议继续食用，可通过观察外观、加热处理、调整储存方式、制作发酵食品、合理丢弃等方式处理。豆腐变质可能由储存温度不当、包装破损、存放时间过长、微生物污染、环境湿度过高等原因引起。
变质的豆腐表面会出现黏液或发霉斑点，颜色可能发黄或发灰。新鲜豆腐应呈现均匀的乳白色，质地细腻无杂质。若发现豆腐有酸臭味或质地松散如渣，说明蛋白质已分解变质。部分轻微变味的豆腐经高温处理后或可食用，但出现明显霉斑时必须丢弃。
轻微变味的豆腐可通过煮沸或油炸高温处理。100度以上高温持续加热15分钟可杀灭部分腐败菌，将豆腐改造成麻辣豆腐或油炸豆腐泡能掩盖异味。但该方法仅适用于未产生黄曲霉毒素的早期变质，若已产生霉斑则高温也无法降解毒素。
新鲜豆腐应浸泡在煮沸冷却的盐水中，置于冰箱冷藏室保存。使用密封容器并每日更换浸泡水能延长保鲜期至3天。北豆腐因含水量低可冷冻保存，解冻后适合炖煮。避免将豆腐与气味强烈的食物混放，防止交叉污染加速变质。
轻微酸化的豆腐可加工成腐乳或臭豆腐。通过添加毛霉菌种进行可控发酵，利用有益菌抑制腐败菌繁殖。此方法需要专业发酵环境和菌种，家庭自制存在肉毒杆菌污染风险。若豆腐已产生刺鼻氨味则不适合再发酵。
严重变质的豆腐会产生黄曲霉毒素等耐高温毒素，食用后可能引发呕吐腹泻。建议用塑料袋密封后丢弃，避免污染其他食物。购买时选择正规厂家产品，注意查看生产日期。散装豆腐建议当天食用完毕，包装豆腐开封后不宜久存。
日常储存豆腐可将整块浸泡在凉开水中，水面高出豆腐2厘米，放入冰箱冷藏并每日换水。烹饪前用流水冲洗表面，充分加热至中心温度达到75度以上。选择质地紧实、豆香浓郁的豆腐产品，避免购买包装漏气或表面渗水的豆腐。若发现豆腐有异常味道或质地改变，为安全起见建议停止食用。
