水果局部腐烂后不建议食用，霉菌毒素可能扩散至看似完好的部分，存在健康风险。
腐烂部位产生的展青霉素等毒素会渗透周围组织，肉眼难以判断污染范围。实验显示距霉斑3厘米处的果肉仍可检出毒素，削除腐烂部分无法确保安全。
霉变水果可能引发急性胃肠炎，出现腹痛腹泻。长期摄入低剂量霉菌毒素会损伤肝脏，增加致癌风险，儿童和免疫力低下者反应更明显。
腐烂过程消耗维生素C、多酚类物质，同时产生有害代谢物。苹果霉变后相邻区域维生素含量下降40%，抗氧化活性显著降低。
热带水果如芒果、香蕉需常温存放，浆果类冷藏不超过3天。乙烯敏感水果猕猴桃、西瓜应单独存放，使用透气保鲜盒延缓腐败。
轻微碰伤可切除损伤部位后尽快食用，表皮发霉的柑橘类不建议食用果肉。制作果酱需在100℃以上熬煮20分钟灭菌。
日常可选择冷冻保存成熟水果，蓝莓、葡萄洗净擦干后冷冻可存放3个月。搭配酸奶或燕麦食用能增加膳食纤维摄入，香蕉奶昔加入奇亚籽补充omega-3。运动后优先选择高钾水果如哈密瓜补充电解质，柑橘类维生素C有助于运动恢复。特殊情况下需彻底切除腐烂部分并高温烹煮，但营养价值已大幅降低。
